自動化實驗室規劃(設計大工程或作計劃)設計原則與傳統醫學實驗室相比，安裝了流水線系統實驗室在自動化程度上大大提高，同時在實驗室設計方面也有更高的要求，以保證各儀器設備能夠發揮最大效能，做到真正意義上的自動化。現就該實驗室的經驗，自動化實驗室設計應本著以下幾點原則：
（1）積極參與，實驗室的使用者應積極參與實驗室規劃設計，向施工方提出具體設計要求，使局部細節更適合該實驗室工作需要；
（2）及早著手，盡量避免后期重復施工，在實驗（experiment)室開始建設前就應考慮實驗室整體規劃，形成詳細實驗室布局圖，并與施工單位討論規劃細節，這就要求實驗室儀器設備招標提前進行，盡早確定儀器廠家型號，規劃各儀器擺位，為后續規劃提供依據；
（3）有效溝通，實驗室的建立離不開與各方面的合作(collaborate)，設計過程中應與施工單位(unit)、LIS公司、儀器設備廠家、醫院信息科、醫院器材科等部門多聯系建立良好的溝通渠道，設計要求應多咨詢專業工程師；
（4）學習經驗（experience)，國內已建成的自動化實驗室有各自設計特點，同時也有不足之處，取長補短能夠使實驗室規劃(設計大工程或作計劃)少走彎路，該實驗室規劃期間主要借鑒了濟南軍區總醫院、福州軍區總醫院、解放軍305醫院等兄弟單位經驗；
（5）考慮自身特性，每家醫院實驗室面積、標本量、檢測項目、檢測時間等各方面要求都有所不同，應根據自身特點進行規劃設計。實驗室臺面每類生物安全防護實驗室根據所處理的微生物及其毒素的危害程度各分為四級。各級實驗室的生物安全防護要求依次為：一級最低，四級最高。檢測實驗室結構和設施、安全操作規程、安全設備適用于對人體具有高度的危險性，通過氣溶膠途徑傳播或傳播途徑不明，尚無有效的疫苗或治療方法的致病微生物及其毒素。
【二級施工資質】實驗（experiment)室設計、建設、裝修、改造、通風、凈化、水電氣、三廢處理，實驗室家具設計生產(Produce)安裝一站式。環境實驗室結構和設施、安全操作規程、安全設備適用于主要通過呼吸途徑使人傳染上嚴重的甚至是致死疾病的致病微生物及其毒素，通常已有預防傳染的疫苗。
